MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Blattella germanica) str. Bge plasmid pBge

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015679	AACA	2	8	3	10	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015679	TAA	2	6	22	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015679	A	6	6	30	35	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015679	TGT	2	6	61	66	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015679	AAT	2	6	67	72	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015679	TTCT	2	8	75	82	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015679	A	11	11	83	93	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015679	A	7	7	156	162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015679	CTT	2	6	186	191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015679	A	7	7	203	209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015679	ATT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015679	AT	3	6	302	307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015679	AGA	2	6	312	317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015679	AGA	2	6	320	325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015679	AAGT	2	8	328	335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015679	TTA	2	6	346	351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015679	TCA	2	6	368	373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015679	AATA	2	8	374	381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015679	ATA	4	12	379	390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015679	A	8	8	418	425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015679	A	8	8	441	448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015679	TTTCT	2	10	452	461	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015679	TC	3	6	492	497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015679	GAA	2	6	536	541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015679	AGA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015679	GTT	2	6	598	603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015679	GTT	2	6	625	630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015679	TATCAG	2	12	638	649	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015679	ATT	2	6	658	663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015679	ATC	2	6	684	689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015679	ATG	2	6	695	700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015679	A	7	7	701	707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015679	T	6	6	741	746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015679	T	9	9	759	767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015679	T	8	8	777	784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015679	AATA	2	8	792	799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015679	A	7	7	2049	2055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015679	CTTATT	2	12	2064	2075	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015679	TA	3	6	2077	2082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015679	TAAAA	2	10	3185	3194	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015679	A	7	7	3198	3204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015679	CG	3	6	3240	3245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015679	CG	3	6	3271	3276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015679	CG	3	6	3302	3307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015679	CG	3	6	3333	3338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015679	CG	3	6	3364	3369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015679	CG	3	6	3395	3400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015679	CG	3	6	3426	3431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015679	CG	3	6	3457	3462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015679	CG	3	6	3488	3493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015679	CG	3	6	3519	3524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015679	CG	3	6	3550	3555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015679	CG	3	6	3581	3586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015679	CG	3	6	3612	3617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015679	CG	3	6	3643	3648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015679	CGGG	3	12	3672	3683	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015679	TAA	2	6	3715	3720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015679	TAAA	2	8	3747	3754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015679	ATT	2	6	3757	3762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015679	TA	7	14	3769	3782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015679	T	7	7	3787	3793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015679	A	6	6	3797	3802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015679	TTC	2	6	3806	3811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015679	C	10	10	3841	3850	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65	NC_015679	C	10	10	3855	3864	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_015679	A	10	10	3901	3910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015679	TA	3	6	3930	3935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015679	AT	3	6	4080	4085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.